Flameはコンポジット、カラーグレーディング、映像編集などの機能が一つのソフトで完結できる点だと思います。
Nuke Familyにも、Nuke Studioというコンポジットと編集の両方の機能を兼ね備えたソフトは存在しますが、Flameの方が長い歴史を持つこともあり、最適化されていて使いやすいと感じます。
また、「Action」というNukeにはないパワフルなノードがあります。2Dだけでなく、3Dの機能もノード内で使うこともでき、3Dライティングやカメラトラッキングも行えます。
ActionはMotion VectorやDeformなど様々な作業を一つのノード内で完結することができます。短所としては、3Dビューア―が少し見づらい点や、Actionノード内でどのような処理が行われているのかが視覚的にわかりにくいという点があり、複数のアーティストと共有するような場合には、混乱を招く恐れもあります。